Huyện Kim Thanh có 40 đơn vị hành chính cấp xã, bao gồm thị trấn Hà Nam và 39 xã: Châu Sơn, Đại Cương, Đồng Hóa, Hoàng Tây, Khả Phong, Kim Bình, Lê Hồ, Liêm Cần, Liêm Phong, Liêm Sơn, Liêm Thuận, Liêm Tiết, Liêm Túc, Liên Sơn, Ngọc Sơn, Nguyễn Úy, Nhật Tân, Nhật Tựu, Phù Vân, Tân Sơn, Thanh Bình, Thanh Chung, Thanh Giang, Thanh Hà, Thanh Hải, Thanh Hương, Thanh Lưu, Thanh Nghị, Thanh Nguyên, Thanh Phong, Thanh Sơn, Thanh Tâm, Thanh Tân, Thanh Thủy, Thanh Tuyền, Thi Sơn, Thụy Lôi, Tượng Lĩnh, Văn Xá.